Overview
Senescence je komplexní biologický proces ovlivňovaný mnoha faktory, včetně genetických a epigenetických. Lokální struktury nukleových kyselin, jako jsou G-kvadruplexy, mohou významně přispívat k regulaci genové exprese a tím ovlivňovat proces stárnutí. V této práci se zaměříme na studium vztahu mezi strukturou a funkcí těchto struktur v kontextu senescence a stárnutí. Pomocí bioinformatických nástrojů identifikujeme potenciální místa pro tvorbu G-kvadruplexů v genomech modelových organismů. Následně budou tyto struktury charakterizovány pomocí biofyzikálních metod. Dále budou studovány interakce těchto struktur s proteiny a jejich vliv na regulaci genové exprese. Na buněčné úrovni budou zkoumány funkční důsledky stabilizace nebo destabilizace těchto struktur pomocí interagujících molekul. Předpokládáme spolupráci se zahraničním pracovištěm specializujícím se na studium senescence.
Školitel: prof. Mgr. Václav Brázda, Ph.D.
Deadline: 30. 4. 2025
Informace k přijímacímu řízení: https://www.fch.vut.cz/uchazeci/prijimacky/d
Kontakt: https://www.fch.vut.cz/lide/alena-sykorova-57872
Email: sykorova@fch.vut.cz
Telefon: +420 541 149 346